Function-call subsystem (в дальнейшем FC-подсистема) является T-подсистемой, предназначенной для использования совместно с S-функцией написанной на языке C. Используя специальные средства, можно обеспечить выполнение подсистемы во время выполнения S-функции. На время выполнения FC-подсистемы работа S-функции останавливается, а по окончании выполнения FC-подсистемы работа S-функции возобновляется. Таким образом, FC-подсистема обеспечивает создание S-функций, запускающих подсистемы составленные из Simulink-блоков. Механизм создания таких S-функций описан в документации Simulink, посвященной созданию S-функций.
Для работы с FC-подсистемой можно использовать также Function-Call Generator и средства пакета событийного моделирования Stateflow.