Программы автоматически определяют, сколько записей из исходного множества данных соответствует каждому узлу. Узлы, которым не соответствуют никакие данные, окрашиваются в белый цвет. Узлы, которым соответствует хотя бы один набор данных, окрашиваются в монохромный цвет, насыщенность которого зависит от количества соответствующих им данных. Цветная шкала в нижней части экрана позволяет соотнести используемые цвета с численными значениями.
Программы также автоматически определяют ошибку квантования, которая представляет собой меру соответствия векторов исходного множества данных тому или иному конкретному узлу. Среднее значение этих величин по всем узлам представляет собой ошибку квантования для АНС в целом. Ошибка квантования для узлов, которым не соответствует никаких данных (т.е. частота равна нулю), изображается обычно белой. Ненулевые значения ошибки квантования показываются различными оттенками одного цвета. Цветная шкала в нижней части экрана позволяет соотнести используемые цвета с численными значениями.
Программные пакеты дают возможность в каждом окне, независимо друг от друга, вывести или скрыть различные аспекты АНС, используя
для этого команды меню либо различные комбинации клавиш:
показать или скрыть метки;
показать или скрыть разграничители;
показать или скрыть изолинии;
показать или скрыть ближайшее окружение кластеров.